Logiciel Alvis : l'extraction d'information et exploration documentaire basées sur des ontologies
Claire Nédellec (contact)
Unité mathématiques et informatique appliquées du génome à l'environnement (MaIAGE)
Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE), Université Paris-Sud - Université Paris-Saclay
Claire Nédellec est directrice de recherche à INRAE. Son domaine de recherche est celui de l’extraction d’information à partir de texte par des méthodes de l’Intelligence Artificielle appliquée aux Sciences du Vivant. Elle s'intéresse particulièrement aux rôles des ontologies ou autres ressources sémantique dans l'extraction et l'organisation des informations.
Robert Bossy (contact)
Unité mathématiques et informatique appliquées du génome à l'environnement (MaIAGE)
Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE), Université Paris-Sud - Université Paris-Saclay
Robert Bossy est ingénieur de recherche à INRAE (L'institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l' environnement) dans l'unité de recherche MaIAGE (Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement) de l'Université Paris-Saclay. Il est spécialisé dans le développement de méthodes et services de Traitement Automatique de la Langue Naturelle.
Mouhamadou BA (contact)
Unité mathématiques et informatique appliquées du génome à l'environnement (MaIAGE)
Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE), Université Paris-Sud - Université Paris-Saclay
Mouhamadou Ba est ingénieur de recherche, membre de l'équipe Migale qui gère la plateforme bioinformatique Migale. Il s'occupe du volet text mining au niveau de la plateforme et coordonne le développement de l'offre de service de fouille de textes et de données.
Présentation
L'atelier "Extraction d'information à partir de texte" initie aux principes de l'extraction d'information à partir de documents pour leur réutilisation et leur partage grâce à des référentiels de type thesaurus, ontologie.L'initiation sera basée sur la démonstration de deux outils simples, un moteur de recherche sémantique (AlvisIR) de la plateforme Alvis et un éditeur d'annotation sémantique collaboratif (AlvisAE). Aucun pré-requis n'est nécessaire.
Programme
- Introduction aux principes de l'extraction d'information et à la fouille de texte guidée par des ontologies
- Prise en main du moteur de recherche sémantique AlvisIR (Alvis Information Retrieval) : expérimenter différents niveaux d'interprétation des requêtes pour des résultats de richesse croissante
- Visualisation et annotation d'entités et de relations d'un corpus textuel avec AlvisAE (Alvis Annotation Editor).
- Sensibilisation à la sémantique formelle et à la recherche de consensus à travers des exemples ludiques.
- Les ressources utilisées seront un corpus documentaire COVID-19 et l'ontologie OntoBiotope pour la description des microbes (habitats, propriété)
Vidéothèque
Focus Alvis IR (2min20)
Focus Florilège & Omnicrobe (3min)
